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Čech begann in der Jugend von Viktoria Pilsen eigentlich als Mittelfeldspieler und spielte nur ab und zu als Torhüter. Nach einem Beinbruch im Alter von 10 Jahren entschied er sich nur noch im Tor zu stehen. 1999 gab Čech im Alter von 17 Jahren beim FK Chmel Blšany sein Debüt als Profi. Zur Saison 2001/02 wechselte Čech für 600.000 Euro zu Sparta Prag, wo er sich bald einen Stammplatz sowie einen nationalen Rekord sichern konnte. Nach nur einer Saison bei Sparta Prag wechselte Čech zu Beginn der Saison 2002/03 für 5 Mio. Euro zu Stade Rennes nach Frankreich.
Im Januar 2004 stimmte Čech einem Wechsel für fünf Jahre zum FC Chelsea zu, welche ihn im Sommer 2004 für 13 Mio. Euro nach London holten. Dort verdrängte er Carlo Cudicini, welcher damals einer der besten Torhüter der Premier League war. Am 1. Februar 2006 verlängerte Čech seinen Vertrag um ein Jahr bis 2010 zu verbesserten Konditionen.
